16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0241 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0241  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  524  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2861  hypothetical protein  53.23 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3503  hypothetical protein  40.62 
 
 
325 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0433937  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6816  hypothetical protein  41.46 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0101  hypothetical protein  31.1 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6629  hypothetical protein  40.97 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452924  normal  0.113875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21130  putative outer membrane lipoprotein  37.91 
 
 
242 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109681  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1270  hypothetical protein  31.02 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000179578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1802  putative lipoprotein  37.25 
 
 
242 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3280  putative lipoprotein  35.53 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4240  putative lipoprotein  35.53 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3080  putative lipoprotein  35.53 
 
 
243 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3332  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.111957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3324  hypothetical protein  30.63 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.35841  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3248  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3429  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>