16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4240 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4240  putative lipoprotein  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3280  putative lipoprotein  99.59 
 
 
243 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3080  putative lipoprotein  97.53 
 
 
243 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3332  putative outer membrane lipoprotein  74.49 
 
 
243 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.111957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3324  hypothetical protein  74.07 
 
 
243 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.35841  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3248  putative outer membrane lipoprotein  74.9 
 
 
243 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3429  putative outer membrane lipoprotein  74.49 
 
 
243 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1802  putative lipoprotein  40.72 
 
 
242 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21130  putative outer membrane lipoprotein  41.63 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109681  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6629  hypothetical protein  38.6 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452924  normal  0.113875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3503  hypothetical protein  39.37 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0433937  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6816  hypothetical protein  37 
 
 
329 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2861  hypothetical protein  34 
 
 
315 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0241  hypothetical protein  35.53 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1270  hypothetical protein  30.6 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000179578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0101  hypothetical protein  32.41 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>