16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6816 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6816  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3503  hypothetical protein  41.72 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0433937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21130  putative outer membrane lipoprotein  40.14 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1802  putative lipoprotein  38.73 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0241  hypothetical protein  41.46 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6629  hypothetical protein  40.6 
 
 		 256 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452924  normal  0.113875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2861  hypothetical protein  41.96 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3280  putative lipoprotein  36 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3080  putative lipoprotein  36 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4240  putative lipoprotein  35.2 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3332  putative outer membrane lipoprotein  34.13 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.111957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3324  hypothetical protein  34.13 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.35841  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3248  putative outer membrane lipoprotein  34.92 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3429  putative outer membrane lipoprotein  34.92 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1270  hypothetical protein  28.8 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000179578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0101  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>