56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1453 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  222  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2180  hypothetical protein  80 
 
 		 105 aa  190  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444997  normal  0.720389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1165  hypothetical protein  81.19 
 
 		 109 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3010  hypothetical protein  75.24 
 
 		 106 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3571  hypothetical protein  75.73 
 
 		 103 aa  176  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985911  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2428  hypothetical protein  77.23 
 
 		 104 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3001  hypothetical protein  77.23 
 
 		 104 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0521  hypothetical protein  71.7 
 
 		 108 aa  166  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3028  hypothetical protein  71.72 
 
 		 120 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0905  hypothetical protein  69.07 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2903  hypothetical protein  59.41 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2576  hypothetical protein  56.12 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2552  hypothetical protein  56.12 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1940  hypothetical protein  56.12 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2471  hypothetical protein  58.51 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0130577 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0376  hypothetical protein  58.51 
 
 		 170 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0733  hypothetical protein  58.51 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1074  hypothetical protein  58.51 
 
 		 170 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0918  hypothetical protein  58.51 
 
 		 107 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0676  hypothetical protein  58.51 
 
 		 107 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0922  hypothetical protein  58.51 
 
 		 107 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0125  hypothetical protein  58.51 
 
 		 107 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2511  hypothetical protein  58.51 
 
 		 107 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0744  hypothetical protein  57.45 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0530  hypothetical protein  59.14 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5884  hypothetical protein  57.45 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2764  hypothetical protein  58.33 
 
 		 99 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2555  hypothetical protein  53.68 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2831  hypothetical protein  52.63 
 
 		 107 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511648  normal  0.844244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2425  hypothetical protein  52.63 
 
 		 107 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0758  hypothetical protein  56.38 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3204  hypothetical protein  55.1 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1755  hypothetical protein  56.04 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.161099  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1470  hypothetical protein  52 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3034  hypothetical protein  45.83 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233347  normal  0.328557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2677  hypothetical protein  46.59 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.913736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1853  hypothetical protein  42.05 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2286  hypothetical protein  41.11 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.55869 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0182  hypothetical protein  38.37 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2012  acetyltransferase  38.37 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1392  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0514  hypothetical protein  36.17 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0538  hypothetical protein  36.17 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3387  hypothetical protein  45.88 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0305  hypothetical protein  45.88 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5222  hypothetical protein  46.43 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4693  hypothetical protein  46.43 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4925  hypothetical protein  45.24 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5343  hypothetical protein  45.24 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.740309  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3023  hypothetical protein  45.24 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0103  hypothetical protein  38.46 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.844457  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0605  hypothetical protein  39.77 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0444  hypothetical protein  39.77 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2118  hypothetical protein  33.72 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2494  hypothetical protein  33.72 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.36203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1914  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>