47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2118 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2494  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  250  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.36203  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  250  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0444  hypothetical protein  54.35 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0605  hypothetical protein  54.35 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2286  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.55869 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0514  hypothetical protein  41.67 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1853  hypothetical protein  39.51 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0538  hypothetical protein  40.48 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2012  acetyltransferase  38.55 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0182  hypothetical protein  38.55 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1392  hypothetical protein  36.59 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0376  hypothetical protein  34.52 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0733  hypothetical protein  34.52 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1074  hypothetical protein  34.52 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0744  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2471  hypothetical protein  34.88 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0130577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2576  hypothetical protein  34.88 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0918  hypothetical protein  34.52 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0125  hypothetical protein  34.52 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0922  hypothetical protein  34.52 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2511  hypothetical protein  34.52 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0676  hypothetical protein  34.52 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2552  hypothetical protein  34.88 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1940  hypothetical protein  34.88 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5884  hypothetical protein  35.23 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2677  hypothetical protein  35.71 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.913736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3034  hypothetical protein  38.89 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233347  normal  0.328557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3028  hypothetical protein  37.08 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0530  hypothetical protein  34.52 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2555  hypothetical protein  35.23 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2425  hypothetical protein  33.94 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1453  hypothetical protein  33.72 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3204  hypothetical protein  37.66 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0758  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2428  hypothetical protein  30.68 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2831  hypothetical protein  33.94 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511648  normal  0.844244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3001  hypothetical protein  30.68 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1914  hypothetical protein  30.12 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1165  hypothetical protein  30.23 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0905  hypothetical protein  32.22 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3010  hypothetical protein  30.23 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2180  hypothetical protein  29.55 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444997  normal  0.720389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3571  hypothetical protein  27.91 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985911  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2764  hypothetical protein  32.47 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1470  hypothetical protein  29.55 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1755  hypothetical protein  30.68 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.161099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>