49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0605 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0605  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  222  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0444  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  222  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2118  hypothetical protein  51.43 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2494  hypothetical protein  51.43 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.36203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2012  acetyltransferase  36.78 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0182  hypothetical protein  36.78 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3034  hypothetical protein  45.12 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233347  normal  0.328557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2286  hypothetical protein  37.36 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.55869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2677  hypothetical protein  39.76 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.913736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3028  hypothetical protein  36.54 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0514  hypothetical protein  36.78 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1392  hypothetical protein  32.61 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0538  hypothetical protein  36.78 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1853  hypothetical protein  34.88 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0744  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0530  hypothetical protein  38.1 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2903  hypothetical protein  36.84 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0376  hypothetical protein  34.52 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0733  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1074  hypothetical protein  34.52 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2555  hypothetical protein  36.78 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0125  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0922  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0918  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2511  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0676  hypothetical protein  34.52 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1940  hypothetical protein  34.12 
 
 
106 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2471  hypothetical protein  34.12 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0130577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2576  hypothetical protein  34.12 
 
 
106 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2552  hypothetical protein  34.12 
 
 
106 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0905  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5884  hypothetical protein  32.94 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1165  hypothetical protein  36.47 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659614  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2831  hypothetical protein  35.63 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511648  normal  0.844244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2425  hypothetical protein  35.63 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1453  hypothetical protein  39.77 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2180  hypothetical protein  39.08 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444997  normal  0.720389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3204  hypothetical protein  34.95 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461134  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3571  hypothetical protein  32.94 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985911  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2764  hypothetical protein  37.21 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0758  hypothetical protein  36.05 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1914  hypothetical protein  27.27 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1470  hypothetical protein  32.18 
 
 
104 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1755  hypothetical protein  34.48 
 
 
100 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.161099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3010  hypothetical protein  31.76 
 
 
106 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3001  hypothetical protein  36.78 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318856  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2428  hypothetical protein  36.78 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0521  hypothetical protein  36.19 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0103  hypothetical protein  27.66 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.844457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>