More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1347 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
166 aa  333  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  46.1 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  46.1 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  44.94 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0826  putative acetyltransferase  39.38 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  37.04 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.160145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3765  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.1 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.46 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.71 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.4166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.46 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.46 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.46 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.46 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0187  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.46628e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000877  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  36.05 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3086  GCN5-related N-acetyltransferase  38.68 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4021  GCN5-related N-acetyltransferase  39.64 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193056  normal  0.623875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.46 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06852  hypothetical protein  38.52 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4402  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0308502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.46 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.858173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4739  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613955  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  38.05 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1874  acetyltransferase  33.8 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.39507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3725  putative acetyltransferase YhhY  29.38 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508439  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2839  GCN5-related N-acetyltransferase  38.94 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0772074  normal  0.0165254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  33.8 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1884  acetyltransferase  33.8 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.364881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1454  GCN5-related N-acetyltransferase  41.96 
 
 
193 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2100  acetyltransferase, GNAT family  33.8 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2069  acetyltransferase  33.8 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2987  ribosomal-protein- alanine GNAT family acetyltransferase  42.86 
 
 
193 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4759  putative acetyltransferase YhhY  30 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal  0.225822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  35.04 
 
 
186 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  35.8 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  37.19 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3857  putative acetyltransferase YhhY  30.86 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2140  acetyltransferase  30.28 
 
 
217 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.140339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  38.32 
 
 
177 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
179 aa  57.8  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  36.79 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
166 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2058  acetyltransferase, GNAT family  34.82 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00654111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2168  acetyltransferase, GNAT family  30.28 
 
 
165 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  37.38 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
185 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03292  predicted acetyltransferase  28.75 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0151809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03245  hypothetical protein  28.75 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0209792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3916  putative acetyltransferase YhhY  30.86 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.73756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0124  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3884  putative acetyltransferase YhhY  28.75 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3736  putative acetyltransferase YhhY  30.86 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3747  putative acetyltransferase YhhY  30.86 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3920  putative acetyltransferase YhhY  28.75 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3250  acetyltransferase, GNAT family  34.82 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000015157  normal  0.297899 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3814  putative acetyltransferase YhhY  32.65 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  48.48 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.19 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0032  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1918  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0771647  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  44.34 
 
 
191 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  44.34 
 
 
191 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  44.34 
 
 
191 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  44.34 
 
 
191 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  44.34 
 
 
191 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  44.34 
 
 
191 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  44.34 
 
 
191 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0272  putative acetyltransferase YhhY  28.12 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.417468  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3640  putative acetyltransferase YhhY  28.12 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2470  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.58 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000909286  normal  0.30524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.63 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>