More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0573 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2881  anthranilate synthase component I  68.63 
 
 
509 aa  703    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0463  anthranilate synthase component I  69.14 
 
 
497 aa  705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612638  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0533  anthranilate synthase component I  69.34 
 
 
497 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3583  anthranilate synthase component I  69.34 
 
 
522 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3023  anthranilate synthase component I  71.15 
 
 
505 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3654  anthranilate synthase component I  88.6 
 
 
499 aa  907    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3575  anthranilate synthase component I  69.34 
 
 
522 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3897  anthranilate synthase component I  73.9 
 
 
495 aa  752    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.839724 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0148  anthranilate synthase component I  63.03 
 
 
501 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3621  anthranilate synthase component I  69.14 
 
 
497 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2758  anthranilate synthase component I  68.3 
 
 
510 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.654997  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0506  anthranilate synthase component I  69.54 
 
 
497 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3556  anthranilate synthase component I  69.34 
 
 
522 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3496  anthranilate synthase component I  68.54 
 
 
497 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.703327  hitchhiker  0.000325099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2909  anthranilate synthase component I  69.34 
 
 
522 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0356  anthranilate synthase component I  88.2 
 
 
499 aa  903    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3123  anthranilate synthase component I  68.69 
 
 
510 aa  698    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.274281  normal  0.443979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3607  anthranilate synthase component I  88.27 
 
 
503 aa  893    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0442  anthranilate synthase component I  88.8 
 
 
499 aa  905    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.223622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4457  anthranilate synthase component I  83.27 
 
 
526 aa  892    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0461  anthranilate synthase component I  68.14 
 
 
497 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3178  anthranilate synthase component I  70.33 
 
 
508 aa  718    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2698  anthranilate synthase component I  68.34 
 
 
497 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2571  anthranilate synthase component I  69.54 
 
 
497 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0940  anthranilate synthase component I  69.34 
 
 
522 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0573  anthranilate synthase component I  100 
 
 
500 aa  1019    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1212  anthranilate synthase component I  85.2 
 
 
517 aa  875    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.18446  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3463  anthranilate synthase component I  75.95 
 
 
491 aa  750    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0439  anthranilate synthase component I  69.14 
 
 
497 aa  705    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.629503  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0644  anthranilate synthase component I  69.34 
 
 
522 aa  700    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1910  anthranilate synthase component I  69.34 
 
 
522 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2860  anthranilate synthase component I  69.54 
 
 
497 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167727  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0534  anthranilate synthase component I  69.54 
 
 
497 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0366  anthranilate synthase component I  87.8 
 
 
519 aa  899    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0752  anthranilate synthase component I  84.8 
 
 
499 aa  876    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0162  anthranilate synthase component I  61.82 
 
 
501 aa  626  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.487235  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2471  anthranilate synthase, component I  60.2 
 
 
494 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  60.24 
 
 
493 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2228  anthranilate synthase, component I  60.71 
 
 
521 aa  586  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  57.8 
 
 
491 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2362  anthranilate synthase component I  57.23 
 
 
495 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  57.8 
 
 
490 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3997  anthranilate synthase component I  55.58 
 
 
496 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346347  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46640  anthranilate synthase component I  55.75 
 
 
492 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  56.69 
 
 
491 aa  542  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3517  anthranilate synthase component I  54.04 
 
 
495 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  54.35 
 
 
493 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0451  anthranilate synthase component I  53.41 
 
 
493 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.365985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0417  anthranilate synthase component I  53.41 
 
 
493 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446736  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0448  anthranilate synthase component I  53.4 
 
 
493 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.422801  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4609  anthranilate synthase component I  53.89 
 
 
493 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2494  anthranilate synthase component I  56 
 
 
492 aa  534  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.184686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0568  anthranilate synthase, component I  53.49 
 
 
493 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  54.55 
 
 
518 aa  528  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  54.51 
 
 
489 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4785  anthranilate synthase component I  53.08 
 
 
493 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.531444 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  54.24 
 
 
505 aa  525  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  54.24 
 
 
505 aa  525  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  55.01 
 
 
495 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  54.04 
 
 
502 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07940  anthranilate synthase component I  53.78 
 
 
492 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0753  anthranilate synthase component I  52.05 
 
 
492 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5118  anthranilate synthase component I  53.88 
 
 
492 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2109  anthranilate synthase component I  52.37 
 
 
502 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  52.38 
 
 
491 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0266  anthranilate synthase component I  51.38 
 
 
501 aa  497  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  51.09 
 
 
491 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.803971 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0157  anthranilate synthase component I  48.43 
 
 
501 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0179  anthranilate synthase component I  48.23 
 
 
501 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  48.91 
 
 
491 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  47.01 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  46.49 
 
 
491 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  46.49 
 
 
491 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  45.06 
 
 
491 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  47.36 
 
 
496 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  45.49 
 
 
491 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  45.53 
 
 
491 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3792  anthranilate synthase, component I  45.26 
 
 
511 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  45.42 
 
 
504 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  44.95 
 
 
494 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3594  anthranilate synthase component I  43.71 
 
 
503 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  42.57 
 
 
492 aa  409  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  44.65 
 
 
485 aa  405  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  44.65 
 
 
485 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1143  anthranilate synthase component I  47.22 
 
 
503 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0793229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1796  anthranilate synthase component I  45.51 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00033121  normal  0.176001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  43.2 
 
 
494 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  45.09 
 
 
493 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  43.43 
 
 
485 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1468  anthranilate synthase component I  44.35 
 
 
496 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.408149  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0156  anthranilate synthase component I  44.83 
 
 
522 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.970752  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  45.44 
 
 
485 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4552  anthranilate synthase component I  43.37 
 
 
508 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3579  anthranilate synthase component I  44.86 
 
 
574 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736027  normal  0.0487715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  44.2 
 
 
489 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0904  anthranilate synthase component I  43.23 
 
 
497 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1566  anthranilate synthase component I  43.03 
 
 
498 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0133412  hitchhiker  0.00994784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4378  anthranilate synthase component I  46.09 
 
 
503 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0206  anthranilate synthase component I  41.37 
 
 
511 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442563  normal  0.201445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1856  anthranilate synthase, component I  43.17 
 
 
512 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.415025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>