58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0710 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  167  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  48.05 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  41.89 
 
 
80 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  48 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  43.24 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  46.75 
 
 
79 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  37.8 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1909  hypothetical protein  40.26 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2240  hypothetical protein  40.26 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.575696  normal  0.0472844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2020  hypothetical protein  40.26 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2568  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3697  hypothetical protein  38.27 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.514391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3669  hypothetical protein  38.27 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3647  hypothetical protein  38.27 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0278  hypothetical protein  39.71 
 
 
80 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3388  hypothetical protein  38.27 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.032209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3427  hypothetical protein  38.27 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3339  hypothetical protein  38.27 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1573  hypothetical protein  38.27 
 
 
82 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330992  normal  0.269924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3744  hypothetical protein  37.04 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3665  hypothetical protein  38.27 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3727  hypothetical protein  43.1 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3322  hypothetical protein  37.04 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2851  hypothetical protein  40.62 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2302  hypothetical protein  32.5 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1901  hypothetical protein  34.33 
 
 
76 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1923  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3173  hypothetical protein  32.88 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0499  hypothetical protein  32.88 
 
 
89 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3645  hypothetical protein  28.77 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0978  hypothetical protein  32.88 
 
 
89 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2987  hypothetical protein  31.34 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3073  hypothetical protein  31.34 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2625  hypothetical protein  31.34 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0793  hypothetical protein  31.34 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2119  hypothetical protein  31.34 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1987  hypothetical protein  31.34 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3039  hypothetical protein  31.34 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67900  hypothetical protein  30.51 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525665  normal  0.0342115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0939  hypothetical protein  31.51 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398854  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2420  hypothetical protein  30.14 
 
 
88 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0761064  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3319  hypothetical protein  31.51 
 
 
87 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5877  hypothetical protein  30.51 
 
 
86 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4850  hypothetical protein  28.77 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4081  hypothetical protein  28.77 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1564  hypothetical protein  29.85 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0850  hypothetical protein  29.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163545  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3643  hypothetical protein  27.03 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0838  hypothetical protein  29.17 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118101  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2082  hypothetical protein  38.64 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0325  hypothetical protein  22.97 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  23.38 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  24 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2026  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  27.63 
 
 
86 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1190  hypothetical protein  38.89 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.369001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  37.04 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  25.35 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>