33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2026 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2026  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1901  hypothetical protein  64.79 
 
 
76 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0278  hypothetical protein  57.14 
 
 
80 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3107  hypothetical protein  47.95 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3643  hypothetical protein  38.46 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1923  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1564  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2420  hypothetical protein  30.3 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0761064  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0838  hypothetical protein  31.82 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1563  hypothetical protein  37.68 
 
 
122 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00217361  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4850  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1354  hypothetical protein  38.81 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0978  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0850  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163545  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0499  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4081  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2987  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1987  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3039  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2625  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0793  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3073  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2119  hypothetical protein  31.82 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0325664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3319  hypothetical protein  33.33 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493809  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0939  hypothetical protein  30.3 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398854  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3645  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  35.29 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  35.94 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  32.88 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  30.43 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  31.94 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  26.87 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>