12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3727 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3727  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3173  hypothetical protein  55.7 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  45.45 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1909  hypothetical protein  44.07 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2240  hypothetical protein  44.07 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.575696  normal  0.0472844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2020  hypothetical protein  44.07 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  43.1 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  47.27 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  38.03 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  38.36 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  34.48 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  32.73 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>