52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0311 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  98.84 
 
 		 86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  95.35 
 
 		 86 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  96.47 
 
 		 86 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5336  hypothetical protein  75.29 
 
 		 86 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0325  hypothetical protein  74.12 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4895  hypothetical protein  72.94 
 
 		 92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04610  hypothetical protein  70.59 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4254  hypothetical protein  65.85 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5877  hypothetical protein  61.18 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67900  hypothetical protein  60 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525665  normal  0.0342115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1923  hypothetical protein  30.56 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  30 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  28 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3645  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2020  hypothetical protein  30.26 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2240  hypothetical protein  30.26 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.575696  normal  0.0472844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1909  hypothetical protein  30.26 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2302  hypothetical protein  28.95 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3173  hypothetical protein  38.89 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2851  hypothetical protein  29.51 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  26.83 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4850  hypothetical protein  29.41 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0761064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2987  hypothetical protein  31.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596635  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  24 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2119  hypothetical protein  31.67 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0325664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0939  hypothetical protein  33.77 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3073  hypothetical protein  31.67 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1564  hypothetical protein  31.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3643  hypothetical protein  32.39 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2625  hypothetical protein  31.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0793  hypothetical protein  31.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1987  hypothetical protein  31.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3039  hypothetical protein  31.67 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0499  hypothetical protein  31.17 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0838  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0978  hypothetical protein  31.17 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  34.69 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  24.64 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1573  hypothetical protein  34.48 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330992  normal  0.269924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3669  hypothetical protein  27.63 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0850  hypothetical protein  32.26 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3647  hypothetical protein  27.63 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3697  hypothetical protein  27.63 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.514391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3388  hypothetical protein  27.63 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.032209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3427  hypothetical protein  27.63 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3322  hypothetical protein  34.48 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3339  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>