20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0157 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0157    100 
 
 		 2801 bp  5553    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2720    99.9 
 
 		 2729 bp  2002    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2468    99.9 
 
 		 2102 bp  1986    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1440    100 
 
 		 1355 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.368011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1409    99.9 
 
 		 2567 bp  1984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0285    100 
 
 		 1349 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0743    100 
 
 		 2312 bp  1994    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0971    100 
 
 		 2219 bp  1992    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  88.37 
 
 		 1806 bp  91.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2612    96.15 
 
 		 341 bp  87.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  83.21 
 
 		 1761 bp  85.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  78.23 
 
 		 1761 bp  63.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  88.46 
 
 		 1839 bp  56  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0235  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  90.7 
 
 		 1011 bp  54  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0245  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  90.7 
 
 		 966 bp  54  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0222  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  90.7 
 
 		 1011 bp  54  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  94.12 
 
 		 1119 bp  52  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  96.55 
 
 		 1821 bp  50.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  85.25 
 
 		 756 bp  50.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.25 
 
 		 756 bp  50.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>