48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05124 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05124  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  157  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001254  outer membrane lipoprotein  90.48 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0078  major outer membrane lipoprotein  68.29 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.73899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2985  major outer membrane lipoprotein, putative  40.91 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3159  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.764364  normal  0.139344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1154  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0547044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1231  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.942856  normal  0.491239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1198  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2623  major outer membrane lipoprotein, putative  46.91 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0202513  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01636  hypothetical protein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2391  major outer membrane lipoprotein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000996739  decreased coverage  0.0000025912 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1878  major outer membrane lipoprotein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1519  major outer membrane lipoprotein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000133689  decreased coverage  0.000000000978616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1954  LPP repeat-containing protein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000368464  unclonable  0.00000000844814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1893  major outer membrane lipoprotein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000101718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1758  major outer membrane lipoprotein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.20557e-22  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1965  LPP repeat-containing protein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.12979e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01646  murein lipoprotein  40.23 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000290635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2186  LPP repeat-containing protein  39.56 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000306733  hitchhiker  0.000000305308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2745  LPP repeat-containing protein  39.56 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000753676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2442  LPP repeat-containing protein  39.56 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000387277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1474  major outer membrane lipoprotein  40.66 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000804906  normal  0.0109348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1510  major outer membrane lipoprotein  40.66 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000917327  hitchhiker  0.00000000217872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1748  major outer membrane lipoprotein  39.56 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.4636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1490  major outer membrane lipoprotein  40.66 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000317688  hitchhiker  0.0000000000000124306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1794  major outer membrane lipoprotein  40.66 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000710111  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1965  major outer membrane lipoprotein  40.66 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000537115  decreased coverage  0.000000000167771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1854  LPP repeat-containing protein  39.56 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000796453  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2583  major outer membrane lipoprotein  39.56 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000315895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1701  LPP repeat-containing protein  40.48 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000609145  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1767  LPP repeat-containing protein  39.56 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000800001  unclonable  0.00000127827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1663  LPP repeat-containing protein  40.48 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000205201  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1795  hypothetical protein  40.74 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000258833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1473  hypothetical protein  39.51 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000926239  normal  0.022042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1966  hypothetical protein  36.96 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000559478  hitchhiker  0.00000000139787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1508  hypothetical protein  41.56 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0719392  hitchhiker  0.00000000192461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1489  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000483373  hitchhiker  0.000000000000889895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0970  major outer membrane lipoprotein, putative  42.05 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000394431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2824  major outer membrane lipoprotein, putative  43.62 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000186041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0833  major outer membrane lipoprotein, putative  43.01 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000224334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1007  major outer membrane lipoprotein, putative  44.68 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000269001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2980  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000253296  normal  0.0290676 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3077  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000256665  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2898  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156021  hitchhiker  0.000454022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1295  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1114  major outer membrane lipoprotein, putative  43.48 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1083  major outer membrane lipoprotein, putative  42.55 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000293694  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1165  major outer membrane lipoprotein, putative  43.18 
 
 		 88 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000170818  hitchhiker  0.000784933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>