56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1295 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1295  major outer membrane lipoprotein, putative  100 
 
 
88 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3077  major outer membrane lipoprotein, putative  98.86 
 
 
88 aa  168  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000256665  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2980  major outer membrane lipoprotein, putative  98.86 
 
 
88 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000253296  normal  0.0290676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2898  major outer membrane lipoprotein, putative  98.86 
 
 
88 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156021  hitchhiker  0.000454022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1231  major outer membrane lipoprotein, putative  96.59 
 
 
88 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.942856  normal  0.491239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1198  major outer membrane lipoprotein, putative  96.59 
 
 
88 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3159  major outer membrane lipoprotein, putative  96.59 
 
 
88 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.764364  normal  0.139344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1154  major outer membrane lipoprotein, putative  96.59 
 
 
88 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0547044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2985  major outer membrane lipoprotein, putative  89.77 
 
 
88 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0970  major outer membrane lipoprotein, putative  87.5 
 
 
88 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000394431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1114  major outer membrane lipoprotein, putative  96.59 
 
 
88 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2824  major outer membrane lipoprotein, putative  88.64 
 
 
88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000186041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1083  major outer membrane lipoprotein, putative  93.18 
 
 
88 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000293694  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1007  major outer membrane lipoprotein, putative  90.91 
 
 
88 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000269001  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1165  major outer membrane lipoprotein, putative  88.64 
 
 
88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000170818  hitchhiker  0.000784933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0833  major outer membrane lipoprotein, putative  87.21 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000224334  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2623  major outer membrane lipoprotein, putative  42.05 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0202513  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4194  putative major outer membrane lipoprotein  50.56 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.719442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1510  major outer membrane lipoprotein  34.83 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000917327  hitchhiker  0.00000000217872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1965  major outer membrane lipoprotein  34.83 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000537115  decreased coverage  0.000000000167771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1794  major outer membrane lipoprotein  34.83 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000710111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1474  major outer membrane lipoprotein  34.83 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000804906  normal  0.0109348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1490  major outer membrane lipoprotein  34.83 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000317688  hitchhiker  0.0000000000000124306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1878  major outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1519  major outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000133689  decreased coverage  0.000000000978616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1954  LPP repeat-containing protein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000368464  unclonable  0.00000000844814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1758  major outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.20557e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2391  major outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000996739  decreased coverage  0.0000025912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1854  LPP repeat-containing protein  35.96 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000796453  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2583  major outer membrane lipoprotein  35.96 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000315895  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1893  major outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000101718  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01636  hypothetical protein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1748  major outer membrane lipoprotein  35.96 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.4636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1767  LPP repeat-containing protein  33.71 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000800001  unclonable  0.00000127827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1965  LPP repeat-containing protein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.12979e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01646  murein lipoprotein  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000290635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2186  LPP repeat-containing protein  34.83 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000306733  hitchhiker  0.000000305308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2745  LPP repeat-containing protein  34.83 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000753676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2442  LPP repeat-containing protein  34.83 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000387277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1701  LPP repeat-containing protein  38.04 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000609145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1663  LPP repeat-containing protein  38.04 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000205201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1473  hypothetical protein  34.44 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000926239  normal  0.022042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1489  hypothetical protein  34.44 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000483373  hitchhiker  0.000000000000889895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1795  hypothetical protein  34.44 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000258833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3344  putative outer membrane lipoprotein  37.31 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02887  predicted outer membrane lipoprotein  31.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0685  putative lipoprotein  31.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02837  hypothetical protein  31.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3193  putative outer membrane lipoprotein  31.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3483  putative outer membrane lipoprotein  31.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0682  putative outer membrane lipoprotein  31.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3299  putative outer membrane lipoprotein  31.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.117538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3443  putative outer membrane lipoprotein  31.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1966  hypothetical protein  34.07 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000559478  hitchhiker  0.00000000139787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4326  putative outer membrane lipoprotein  30.38 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1508  hypothetical protein  32.94 
 
 
79 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0719392  hitchhiker  0.00000000192461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>