14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003371 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003371  putative YscY  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01735  hypothetical protein  76.11 
 
 		 112 aa  180  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0036  type III secretion chaperone YscY  35.58 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144179  normal  0.888827 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.22 
 
 		 689 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  29.35 
 
 		 417 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  36.11 
 
 		 284 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  26.19 
 
 		 475 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 870 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.48 
 
 		 598 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 357 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.53 
 
 		 648 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.29 
 
 		 397 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 243 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>