31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2233 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2233  fumarate reductase subunit D  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00134  fumarate reductase subunit D  90.76 
 
 		 125 aa  222  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002234  fumarate reductase subunit D  89.08 
 
 		 125 aa  221  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2791  fumarate reductase subunit D  74.17 
 
 		 120 aa  197  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0984394  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0351  fumarate reductase subunit D  56.91 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0340  fumarate reductase subunit D  54.17 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4395  fumarate reductase subunit D  54.17 
 
 		 119 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4710  fumarate reductase subunit D  54.17 
 
 		 119 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4622  fumarate reductase subunit D  54.78 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166672 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03985  hypothetical protein  54.78 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5669  fumarate reductase subunit D  54.78 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0558421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04023  fumarate reductase subunit D  54.78 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3859  fumarate reductase subunit D  54.78 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3839  fumarate reductase D subunit  54.78 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4683  fumarate reductase subunit D  53.33 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4701  fumarate reductase subunit D  53.91 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4758  fumarate reductase subunit D  53.91 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.540405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4610  fumarate reductase subunit D  53.91 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244223  normal  0.649983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4618  fumarate reductase subunit D  53.91 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4737  fumarate reductase subunit D  53.91 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0416  fumarate reductase subunit D  53.91 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3670  fumarate reductase subunit D  50 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0717  fumarate reductase subunit D  50 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0379  fumarate reductase subunit D  49.57 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3816  fumarate reductase subunit D  49.12 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3761  fumarate reductase subunit D  51.38 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3939  fumarate reductase subunit D  50.46 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3281  fumarate reductase, D subunit  47.58 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.660401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0468  fumarate reductase subunit D  44.44 
 
 		 118 aa  95.9  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1280  fumarate reductase subunit D  43.7 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000378267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1722  fumarate reductase subunit D  31.03 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.459919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>