31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3839 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3839  fumarate reductase D subunit  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03985  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5669  fumarate reductase subunit D  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0558421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4622  fumarate reductase subunit D  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3859  fumarate reductase subunit D  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4710  fumarate reductase subunit D  99.16 
 
 		 119 aa  235  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4395  fumarate reductase subunit D  99.16 
 
 		 119 aa  235  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04023  fumarate reductase subunit D  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4683  fumarate reductase subunit D  98.32 
 
 		 119 aa  233  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4737  fumarate reductase subunit D  92.44 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4618  fumarate reductase subunit D  92.44 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4610  fumarate reductase subunit D  92.44 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244223  normal  0.649983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4758  fumarate reductase subunit D  92.44 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.540405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4701  fumarate reductase subunit D  92.44 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0340  fumarate reductase subunit D  88.24 
 
 		 119 aa  214  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0416  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 		 119 aa  208  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3670  fumarate reductase subunit D  85.59 
 
 		 118 aa  207  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0717  fumarate reductase subunit D  85.59 
 
 		 118 aa  207  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3816  fumarate reductase subunit D  84.75 
 
 		 118 aa  206  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0379  fumarate reductase subunit D  79.83 
 
 		 118 aa  194  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3761  fumarate reductase subunit D  87.04 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3939  fumarate reductase subunit D  86.11 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0468  fumarate reductase subunit D  81.51 
 
 		 118 aa  166  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2233  fumarate reductase subunit D  54.78 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002234  fumarate reductase subunit D  50.88 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2791  fumarate reductase subunit D  52.17 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0984394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00134  fumarate reductase subunit D  49.12 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0351  fumarate reductase subunit D  50 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1280  fumarate reductase subunit D  44.92 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000378267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3281  fumarate reductase, D subunit  52.63 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.660401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1722  fumarate reductase subunit D  40.83 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.459919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>