31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0416 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0416  fumarate reductase subunit D  100 
 
 
119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3670  fumarate reductase subunit D  88.98 
 
 
118 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0717  fumarate reductase subunit D  88.98 
 
 
118 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3816  fumarate reductase subunit D  88.14 
 
 
118 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3839  fumarate reductase D subunit  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03985  hypothetical protein  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5669  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0558421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4737  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4618  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4610  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244223  normal  0.649983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4758  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.540405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4701  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4622  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.166672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3859  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04023  fumarate reductase subunit D  84.87 
 
 
119 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4395  fumarate reductase subunit D  84.03 
 
 
119 aa  207  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4710  fumarate reductase subunit D  84.03 
 
 
119 aa  207  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4683  fumarate reductase subunit D  83.19 
 
 
119 aa  205  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0379  fumarate reductase subunit D  83.19 
 
 
118 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0340  fumarate reductase subunit D  78.15 
 
 
119 aa  197  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000189015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3761  fumarate reductase subunit D  83.33 
 
 
118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3939  fumarate reductase subunit D  82.41 
 
 
118 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0468  fumarate reductase subunit D  78.15 
 
 
118 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2233  fumarate reductase subunit D  53.91 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00134  fumarate reductase subunit D  50 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002234  fumarate reductase subunit D  49.12 
 
 
125 aa  123  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2791  fumarate reductase subunit D  48.7 
 
 
120 aa  120  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0984394  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0351  fumarate reductase subunit D  50.83 
 
 
121 aa  120  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1280  fumarate reductase subunit D  44.92 
 
 
115 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000378267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3281  fumarate reductase, D subunit  45.22 
 
 
125 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.660401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1722  fumarate reductase subunit D  39.82 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.459919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>