30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0305 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0305  tRNA-Gln  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0014  tRNA-Gln  89.29 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0058  tRNA-Gln  89.29 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429092  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0073  tRNA-Gln  89.29 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0767991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0019  tRNA-Gln  89.29 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0019    87.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255939  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  88.46 
 
 
75 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t54  tRNA-Gln  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0869713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.275376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60290  tRNA-Gln  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60300  tRNA-Gln  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61760  tRNA-Gln  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486139  hitchhiker  0.00483017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t18  tRNA-Gln  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3091  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0052  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>