99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0302 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0302  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 104 bp  206  8e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0126  5S ribosomal RNA  98.08 
 
 		 104 bp  190  5e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_5SB  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 111 bp  56  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000417373  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_5SA  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 111 bp  56  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  96.88 
 
 		 111 bp  56  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  96.88 
 
 		 111 bp  56  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0020  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0094  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0082  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0058  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000857994  normal  0.747107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0051  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0040  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000114332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0035  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0007  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0282377  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0025  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 83 bp  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000694751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0008  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000537705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0079  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0007  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0528996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0077  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 121 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0062  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 121 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000016841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SG  1 ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000030846  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0079  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0068  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0063  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0022  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0019  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.296052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0008  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0020  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0023  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0063  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0068  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0011  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 120 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SD  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SC  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0003  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0008  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0009  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0057  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SB  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0481886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SA  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1370  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 36 bp  48.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0166  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0022  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1803  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1797  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.20962e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1618  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.636533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1583  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1564  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0451  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0656  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 36 bp  48.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.757563  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0833  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 109 bp  48.1  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0380  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 109 bp  48.1  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SE  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SF  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr06  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr03  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 103 bp  48.1  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1781  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 127 bp  48.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.386687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1705  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0412  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 124 bp  48.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0961397  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0184  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 127 bp  48.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00848557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0171  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 124 bp  48.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.114955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0082  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 124 bp  48.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1832  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.172239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0022  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 124 bp  48.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0311578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0059  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 205 bp  46.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0027  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 205 bp  46.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.866898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>