247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0380 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0380  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 109 bp  216  9e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0833  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 109 bp  216  9e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0008  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 119 bp  95.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0008  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 		 114 bp  91.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000537705  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr03  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 103 bp  89.7  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr06  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 119 bp  87.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0019  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 119 bp  87.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.296052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0079  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 119 bp  87.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0068  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0020  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0007  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0528996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0079  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0022  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0068  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0063  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0063  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0023  5S ribosomal RNA  96.08 
 
 		 114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SA  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SB  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0481886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SC  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SD  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SE  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SF  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SG  1 ribosomal RNA  100 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000030846  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1705  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1832  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.172239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0022  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0166  5S ribosomal RNA  97.5 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 120 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0077  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0062  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000016841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0412  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 124 bp  69.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0961397  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0184  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 127 bp  69.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00848557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0171  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 124 bp  69.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.114955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1781  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 127 bp  69.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.386687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0082  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 124 bp  69.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0022  5S ribosomal RNA  95.35 
 
 		 124 bp  69.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0311578  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0451  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1564  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1583  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1618  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.636533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1797  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.20962e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1803  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  69.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5740  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5743  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5749  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 111 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5752  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5755  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5758  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5761  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 111 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 111 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5773  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000449498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-1  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-2  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-3  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-5  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-7  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-8  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000275902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000843494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SH  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SI  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000960299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>