259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE_5SA on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE_5SA  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  220  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_5SB  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  220  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000417373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0035  5S ribosomal RNA  93.1 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0058  5S ribosomal RNA  93.1 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000857994  normal  0.747107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0007  5S ribosomal RNA  93.1 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0282377  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0040  5S ribosomal RNA  93.1 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000114332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0082  5S ribosomal RNA  93.1 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0094  5S ribosomal RNA  93.1 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0051  5S ribosomal RNA  93.1 
 
 		 115 bp  83.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0056  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000667986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5740  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5743  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5746  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5749  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 111 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5755  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5758  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5761  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5764  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5767  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 111 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000116151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5770  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 111 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000576243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-1  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5627  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0852  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000741704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-2  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-3  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-4  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000434423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-5  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-6  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-7  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-8  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-5s-9  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000019949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r02  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.069713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_1  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_10  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_11  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000275902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_12  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000843494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_13  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_2  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_3  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_4  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 114 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000269738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_5  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_6  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_7  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_8  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-5SrRNA_9  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 118 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0344  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.316111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SA  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SB  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SC  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SD  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000175937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SE  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.711544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SF  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.932076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba5SG  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5620  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.45456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0076  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0067  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0064  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0070  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0092  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000371886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0140  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0073  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000636954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0067  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0064  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0005  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0144  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000122827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0333  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0073  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0032  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0299918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0012  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0012  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00424796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0187  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000535422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0305  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0036  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0029  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.350698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0017  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000279658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0061  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0056  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0032  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000010425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0012  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0094  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000653707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0107  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000335281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0005  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>