16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0627 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0627  ribosomal protein L34e  100 
 
 		 91 aa  184  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1752  Ribosomal protein L34e  44.58 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1110  50S ribosomal protein L34e  44.71 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1730  50S ribosomal protein L34e  49.41 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000489447 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0398  50S ribosomal protein L34e  42.35 
 
 		 84 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0786014  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1363  50S ribosomal protein L34e  42.35 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.603517  normal  0.0122025 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1500  50S ribosomal protein L34e  40.74 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07980  60s ribosomal protein l34-b, putative  32.94 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1128  50S ribosomal protein L34e  36.9 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.268556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0117  ribosomal protein L34e  33.73 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000303876  hitchhiker  0.0000372706 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44291  predicted protein  34.07 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04522  ribosomal protein L34 protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03040)  31.87 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.154238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0978  50S ribosomal protein L34e  33.33 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1650  50S ribosomal protein L34e  33.33 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473141  normal  0.970991 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69102  ribosomal protein L34  32.56 
 
 		 122 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0264  50S ribosomal protein L34e  32.1 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>