11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0978 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0978  50S ribosomal protein L34e  100 
 
 		 89 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1650  50S ribosomal protein L34e  97.75 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473141  normal  0.970991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0264  50S ribosomal protein L34e  94.38 
 
 		 89 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1500  50S ribosomal protein L34e  75.28 
 
 		 89 aa  143  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1128  50S ribosomal protein L34e  68.54 
 
 		 89 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.268556  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1752  Ribosomal protein L34e  39.77 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07980  60s ribosomal protein l34-b, putative  35.9 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69102  ribosomal protein L34  35.9 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04522  ribosomal protein L34 protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03040)  32.05 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.154238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0627  ribosomal protein L34e  33.33 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1110  50S ribosomal protein L34e  26.83 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>