14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1500 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1500  50S ribosomal protein L34e  100 
 
 		 89 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1650  50S ribosomal protein L34e  76.4 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473141  normal  0.970991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0264  50S ribosomal protein L34e  77.53 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0978  50S ribosomal protein L34e  75.28 
 
 		 89 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1128  50S ribosomal protein L34e  65.91 
 
 		 89 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.268556  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1752  Ribosomal protein L34e  37.5 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07980  60s ribosomal protein l34-b, putative  39.74 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0627  ribosomal protein L34e  40.74 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69102  ribosomal protein L34  37.18 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04522  ribosomal protein L34 protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03040)  38.89 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.154238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1110  50S ribosomal protein L34e  30.49 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0398  50S ribosomal protein L34e  28.41 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0786014  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1363  50S ribosomal protein L34e  25 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.603517  normal  0.0122025 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1730  50S ribosomal protein L34e  24.14 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000489447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>