11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1110 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1110  50S ribosomal protein L34e  100 
 
 		 84 aa  164  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0398  50S ribosomal protein L34e  89.16 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0786014  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1730  50S ribosomal protein L34e  76.19 
 
 		 84 aa  135  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000489447 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1363  50S ribosomal protein L34e  75.9 
 
 		 98 aa  128  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.603517  normal  0.0122025 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1752  Ribosomal protein L34e  43.53 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0627  ribosomal protein L34e  44.71 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1128  50S ribosomal protein L34e  28.05 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.268556  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1500  50S ribosomal protein L34e  30.49 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0117  ribosomal protein L34e  33.73 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000303876  hitchhiker  0.0000372706 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0978  50S ribosomal protein L34e  26.83 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1650  50S ribosomal protein L34e  26.83 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473141  normal  0.970991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>