33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0276 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0276  DNA-directed RNA polymerase subunit N  100 
 
 		 90 aa  190  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1048  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  64.52 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.143977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2218  DNA-directed RNA polymerase subunit N  62.3 
 
 		 62 aa  90.5  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2141  DNA-directed RNA polymerase subunit N  58.06 
 
 		 66 aa  90.1  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000023136  hitchhiker  0.0000569009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1572  DNA-directed RNA polymerase subunit N  55.22 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.439868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0318  DNA-directed RNA polymerase subunit N  51.52 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1425  DNA-directed RNA polymerase subunit N  59.02 
 
 		 62 aa  87.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0307303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1240  DNA-directed RNA polymerase subunit N  57.38 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00689363  normal  0.933035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0427  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  55.56 
 
 		 64 aa  87  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2391  DNA-directed RNA polymerase subunit N  57.38 
 
 		 62 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2381  DNA-directed RNA polymerase subunit N  55.74 
 
 		 62 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000430291  normal  0.613326 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0637  DNA-directed RNA polymerase subunit N  52.24 
 
 		 68 aa  83.6  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2547  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  52.38 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0267  DNA-directed RNA polymerase subunit N  52.24 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2517  DNA-directed RNA polymerase subunit N  52.38 
 
 		 64 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.844186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1823  DNA-directed RNA polymerase subunit N  52.38 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1807  DNA-directed RNA polymerase subunit N  50.82 
 
 		 62 aa  81.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0571  DNA-directed RNA polymerase subunit N  50.75 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.866195  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0480  DNA-directed RNA polymerase subunit N  54.1 
 
 		 61 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2596  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  47.69 
 
 		 66 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241725  normal  0.131513 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1347  DNA-directed RNA polymerase subunit N  49.25 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307343  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2331  DNA-directed RNA polymerase subunit N  51.61 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000403569  hitchhiker  0.000579173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2895  DNA-directed RNA polymerase subunit N  52.46 
 
 		 62 aa  78.2  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1094  DNA-directed RNA polymerase subunit N  47.06 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10821  predicted protein  45.31 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234263  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2101  DNA-directed RNA polymerase subunit N  48.39 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1973  DNA-directed RNA polymerase subunit N  51.61 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.3164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0693  DNA-directed RNA polymerase subunit N  50 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.719757  normal  0.224303 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88539  predicted protein  43.94 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00680  DNA-directed RNA polymerases i, ii, and iii 8.3 kda polypeptide, putative  43.08 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591881  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11183  DNA-directed RNA polymerases N/8 kDa subunit superfamily (AFU_orthologue; AFUA_7G02620)  40.91 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.046597  hitchhiker  0.00000000000146531 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37912  DNA-directed RNA Polymerase II subunit L  42.65 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1477  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  32.88 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.627329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>