33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0318 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0318  DNA-directed RNA polymerase subunit N  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1048  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  56.06 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.143977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2141  DNA-directed RNA polymerase subunit N  54.55 
 
 		 66 aa  87.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000023136  hitchhiker  0.0000569009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0276  DNA-directed RNA polymerase subunit N  51.52 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1240  DNA-directed RNA polymerase subunit N  54.1 
 
 		 62 aa  83.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00689363  normal  0.933035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1807  DNA-directed RNA polymerase subunit N  50.82 
 
 		 62 aa  80.1  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2218  DNA-directed RNA polymerase subunit N  54.1 
 
 		 62 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2547  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  49.21 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1572  DNA-directed RNA polymerase subunit N  48.39 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.439868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2895  DNA-directed RNA polymerase subunit N  50.82 
 
 		 62 aa  77  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2596  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  44.62 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241725  normal  0.131513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1425  DNA-directed RNA polymerase subunit N  47.54 
 
 		 62 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0307303 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0427  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  44.44 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2381  DNA-directed RNA polymerase subunit N  49.18 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000430291  normal  0.613326 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1823  DNA-directed RNA polymerase subunit N  42.86 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2517  DNA-directed RNA polymerase subunit N  44.44 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.844186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2391  DNA-directed RNA polymerase subunit N  47.54 
 
 		 62 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1973  DNA-directed RNA polymerase subunit N  50 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.3164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0480  DNA-directed RNA polymerase subunit N  51.72 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10821  predicted protein  46.77 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234263  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2331  DNA-directed RNA polymerase subunit N  50 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000403569  hitchhiker  0.000579173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0693  DNA-directed RNA polymerase subunit N  41.94 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.719757  normal  0.224303 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88539  predicted protein  42.65 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00680  DNA-directed RNA polymerases i, ii, and iii 8.3 kda polypeptide, putative  41.43 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591881  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2101  DNA-directed RNA polymerase subunit N  45.16 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1347  DNA-directed RNA polymerase subunit N  47.06 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307343  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0637  DNA-directed RNA polymerase subunit N  47.06 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0267  DNA-directed RNA polymerase subunit N  45.1 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0571  DNA-directed RNA polymerase subunit N  45.1 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.866195  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1094  DNA-directed RNA polymerase subunit N  45.1 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11183  DNA-directed RNA polymerases N/8 kDa subunit superfamily (AFU_orthologue; AFUA_7G02620)  36.49 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.046597  hitchhiker  0.00000000000146531 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1477  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  34.67 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.627329  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37912  DNA-directed RNA Polymerase II subunit L  39.68 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>