33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0571 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0571  DNA-directed RNA polymerase subunit N  100 
 
 		 68 aa  140  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.866195  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0267  DNA-directed RNA polymerase subunit N  98.53 
 
 		 68 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1347  DNA-directed RNA polymerase subunit N  98.53 
 
 		 68 aa  138  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307343  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0637  DNA-directed RNA polymerase subunit N  80.88 
 
 		 68 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1094  DNA-directed RNA polymerase subunit N  58.82 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0276  DNA-directed RNA polymerase subunit N  50.75 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1048  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  43.28 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.143977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2218  DNA-directed RNA polymerase subunit N  44.78 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1425  DNA-directed RNA polymerase subunit N  47.76 
 
 		 62 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0307303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1240  DNA-directed RNA polymerase subunit N  55.77 
 
 		 62 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00689363  normal  0.933035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2391  DNA-directed RNA polymerase subunit N  44.78 
 
 		 62 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2381  DNA-directed RNA polymerase subunit N  43.28 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000430291  normal  0.613326 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0480  DNA-directed RNA polymerase subunit N  56.86 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2141  DNA-directed RNA polymerase subunit N  43.55 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000023136  hitchhiker  0.0000569009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2547  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  51.85 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2895  DNA-directed RNA polymerase subunit N  43.28 
 
 		 62 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1807  DNA-directed RNA polymerase subunit N  46.15 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0427  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  50.94 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1572  DNA-directed RNA polymerase subunit N  40.3 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.439868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2596  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  39.44 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241725  normal  0.131513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1823  DNA-directed RNA polymerase subunit N  42.03 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2517  DNA-directed RNA polymerase subunit N  49.06 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.844186  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0318  DNA-directed RNA polymerase subunit N  45.1 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2331  DNA-directed RNA polymerase subunit N  38.81 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000403569  hitchhiker  0.000579173 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1973  DNA-directed RNA polymerase subunit N  41.18 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.3164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0693  DNA-directed RNA polymerase subunit N  39.71 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.719757  normal  0.224303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2101  DNA-directed RNA polymerase subunit N  38.24 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00680  DNA-directed RNA polymerases i, ii, and iii 8.3 kda polypeptide, putative  46.15 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591881  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11183  DNA-directed RNA polymerases N/8 kDa subunit superfamily (AFU_orthologue; AFUA_7G02620)  46.15 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.046597  hitchhiker  0.00000000000146531 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10821  predicted protein  44.23 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37912  DNA-directed RNA Polymerase II subunit L  49.06 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1477  RNA polymerase, N/8 Kd subunit  42.47 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.627329  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88539  predicted protein  40.38 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>