20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3312 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  100 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  47.35 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  38.37 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  38.61 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  38.61 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  38.61 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  38.22 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  37.9 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1964  protein of unknown function DUF1396  34.6 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  34.15 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  36.98 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  31.56 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12959  lipoprotein lppX  33.61 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  30.33 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  25.77 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  29.24 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2927  hypothetical protein  26.32 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1961  hypothetical protein  30.77 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  23.53 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1103  protein of unknown function DUF1396  26.71 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000223409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>