18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11399 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  100 
 
 
261 aa  521  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  36.06 
 
 
268 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  34.93 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  34.93 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  34.93 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  32.53 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  31.6 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  30.2 
 
 
227 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  33.06 
 
 
234 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  29.96 
 
 
256 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  27.1 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  27.23 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12959  lipoprotein lppX  30.29 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200622  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1964  protein of unknown function DUF1396  29.22 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  23.58 
 
 
225 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1501  hypothetical protein  24.05 
 
 
218 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268016  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  21.72 
 
 
234 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  23.84 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>