23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  100 
 
 		 227 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  37 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1501  hypothetical protein  38.43 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  39.47 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  35.24 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  35.65 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  35.65 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  35.65 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  33.77 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  33 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  35.92 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  31.84 
 
 		 262 aa  101  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  32.31 
 
 		 244 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  30.56 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  34.15 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  28.57 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1964  protein of unknown function DUF1396  28.64 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12959  lipoprotein lppX  26.41 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2927  hypothetical protein  29.5 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1961  hypothetical protein  27.12 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2950  hypothetical protein  28.21 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.365698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1103  protein of unknown function DUF1396  25.38 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000223409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2651  hypothetical protein  25.24 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>