20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11440 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  100 
 
 
236 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  52.8 
 
 
236 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  52.8 
 
 
236 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  52.8 
 
 
236 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  50.64 
 
 
234 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  51.4 
 
 
256 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  36.4 
 
 
243 aa  148  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  38.67 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  34.85 
 
 
244 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1964  protein of unknown function DUF1396  32.93 
 
 
275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  33.77 
 
 
227 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  31.47 
 
 
261 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  27.59 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12959  lipoprotein lppX  31.28 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200622  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  28.63 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  27.12 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  21.89 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1501  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268016  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1103  protein of unknown function DUF1396  26.52 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000223409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2950  hypothetical protein  24.38 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.365698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>