12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0055 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0055  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0044  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.123101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0050  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0724016  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0050  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06590  tRNA-His  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.435394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0057  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0038  tRNA-His  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000137357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0075  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000858856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0082  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>