35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_R0050 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0724016  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0055  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0044  tRNA-Pro  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.123101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0015  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0016  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000335758  normal  0.0133368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0059  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0082  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0057  tRNA-Pro  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0439  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000182942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0061  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213115  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0059  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778422  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079978  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>