More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0075 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_R0075  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000858856  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0025  tRNA-Ala  96 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0039  tRNA-Ala  96 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575536  normal  0.4318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0081  tRNA-Ala  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.659865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0002  tRNA-Ala  97.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla03  tRNA-Ala  91.07 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  89.06 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0019  tRNA-Ala  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000697155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0066  tRNA-Ala  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0010  tRNA-Ala  93.48 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  93.48 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0080  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755627  normal  0.408373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0001  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0079  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520494  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0043  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0640693  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0012  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0028  tRNA-Ala  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0089  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4330  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0013  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0063  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0088  tRNA-Ala  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0028  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0053  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0071  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0049  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254858  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0020  tRNA-Ala  87.3 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0026  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635837  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0027  tRNA-Ala  94.87 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.392789  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0086  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0087  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.456673  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0055  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0055  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0036  tRNA-Ala  94.87 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000174487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0046  tRNA-Ala  88.89 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00198134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t37  tRNA-Ala  91.3 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295961  normal  0.0193801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t39  tRNA-Ala  91.3 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304224  normal  0.0192594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t41  tRNA-Ala  91.3 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0706595  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0033  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.106425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0031  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0725806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0015  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.176699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0021  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000859233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2246  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2332  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0355369  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1456  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00170878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0047  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.055133  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0029  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0737058 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1790  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0055  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000025235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0046  tRNA-Ala  94.74 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0265781  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0022  tRNA-Ala  92.5 
 
 
78 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t01  tRNA-Ala  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0040  tRNA-Ala  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0994  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0502689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0025  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0002  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0035  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0036  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0016  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104891  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna15  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0054  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876029  normal  0.742043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna17  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0038  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000224976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0058  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000693286  normal  0.541415 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0022  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0056  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000771632  normal  0.557555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0039  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6047  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6015  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00508313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t29  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t31  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA36  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA38  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851121  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0062  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6008  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.458315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0020  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000865622  hitchhiker  2.9719399999999996e-20 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0018  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00619278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0049  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306832 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0022  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0084  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0057  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0062  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259721  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0065  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0073  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.153507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0004  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0028446  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0019  tRNA-Ala  92.31 
 
 
76 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>