15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1322 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1322  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.140975  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4557  hypothetical protein  26.74 
 
 
416 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0932353 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4504  hypothetical protein  28.47 
 
 
423 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301287  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4279  hypothetical protein  27.53 
 
 
435 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4213  hypothetical protein  30.1 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5524  hypothetical protein  28.1 
 
 
508 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0370  hypothetical protein  23.5 
 
 
663 aa  62.8  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.246982  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4713  hypothetical protein  32.06 
 
 
458 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.356808  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8939  hypothetical protein  30.17 
 
 
523 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00366232  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2241  hypothetical protein  28.57 
 
 
656 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4865  hypothetical protein  23.81 
 
 
587 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7296  hypothetical protein  29.17 
 
 
479 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0185211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0036  hypothetical protein  28.17 
 
 
460 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0685  hypothetical protein  29.36 
 
 
540 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.771195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5433  hypothetical protein  25.71 
 
 
483 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>