25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1659 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1659    100 
 
 
324 bp  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1089  hypothetical protein  96.97 
 
 
300 bp  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1279  hypothetical protein  96.96 
 
 
306 bp  515  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal  0.0797066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4827  hypothetical protein  96.62 
 
 
306 bp  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.013384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4752    95.79 
 
 
469 bp  502  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4866    83.95 
 
 
315 bp  196  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2094  IS4 family transposase  83.68 
 
 
525 bp  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3602    82.63 
 
 
363 bp  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.661353  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4294    82.35 
 
 
558 bp  119  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1051  IS4 family transposase  81.86 
 
 
633 bp  111  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3079    82.63 
 
 
525 bp  101  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1935  hypothetical protein  84.33 
 
 
279 bp  99.6  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0520629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4009    82.8 
 
 
582 bp  97.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2442    80.56 
 
 
306 bp  95.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0048    83.1 
 
 
489 bp  91.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4832  hypothetical protein  81.1 
 
 
474 bp  61.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.870772  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4887    82.98 
 
 
348 bp  60  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3594  hypothetical protein  80.31 
 
 
501 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3588  hypothetical protein  80.31 
 
 
501 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4843  hypothetical protein  80.31 
 
 
474 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4879  hypothetical protein  80.31 
 
 
501 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3737    87.04 
 
 
474 bp  52  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0704598  normal  0.0210016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3233    78.98 
 
 
540 bp  50.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3601  hypothetical protein  93.55 
 
 
189 bp  46.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0842659  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1290  hypothetical protein  93.55 
 
 
210 bp  46.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>