27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3602 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3602    100 
 
 
363 bp  720    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.661353  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1935  hypothetical protein  93.12 
 
 
279 bp  396  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0520629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2442    87.95 
 
 
306 bp  230  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4866    87.85 
 
 
315 bp  202  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5035    98.7 
 
 
336 bp  145  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674482  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4865  hypothetical protein  98.7 
 
 
336 bp  145  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3589  hypothetical protein  98.7 
 
 
336 bp  145  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1089  hypothetical protein  83.64 
 
 
300 bp  139  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1279  hypothetical protein  83.64 
 
 
306 bp  139  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal  0.0797066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3217    97.4 
 
 
336 bp  137  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00851219  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1693    97.4 
 
 
228 bp  137  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173523  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2441    96.1 
 
 
336 bp  129  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4752    83.25 
 
 
469 bp  125  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4827  hypothetical protein  82.71 
 
 
306 bp  123  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.013384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1659    82.63 
 
 
324 bp  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1660  hypothetical protein  92.21 
 
 
246 bp  105  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4753  hypothetical protein  92.21 
 
 
246 bp  105  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4826  hypothetical protein  92.21 
 
 
246 bp  105  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0237687  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1280  hypothetical protein  90.91 
 
 
246 bp  97.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.700955  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1088  hypothetical protein  90.91 
 
 
246 bp  97.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1051  IS4 family transposase  100 
 
 
633 bp  89.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4888  hypothetical protein  100 
 
 
129 bp  89.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4295  hypothetical protein  100 
 
 
372 bp  89.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.171019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4009    89.8 
 
 
582 bp  58  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2094  IS4 family transposase  89.8 
 
 
525 bp  58  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0048    89.8 
 
 
489 bp  58  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3079    94.29 
 
 
525 bp  54  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>