31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1935 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1935  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  183  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0520629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1051  IS4 family transposase  71.59 
 
 
210 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1197  hypothetical protein  58.73 
 
 
160 aa  72  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4899  hypothetical protein  58.73 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1650  hypothetical protein  57.14 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169353  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1376  hypothetical protein  59.68 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4555  hypothetical protein  68 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0721243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4888  hypothetical protein  78.57 
 
 
42 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1279  hypothetical protein  68.75 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal  0.0797066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1089  hypothetical protein  68.75 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0173  hypothetical protein  41.33 
 
 
243 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.372645  normal  0.496581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2035  hypothetical protein  59.65 
 
 
57 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00355026  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2094  IS4 family transposase  59.62 
 
 
174 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4827  hypothetical protein  68.09 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.013384  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  43.21 
 
 
330 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  43.21 
 
 
330 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  41.98 
 
 
330 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4832  hypothetical protein  57.78 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.870772  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3588  hypothetical protein  57.78 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3594  hypothetical protein  57.78 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4879  hypothetical protein  55.56 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1290  hypothetical protein  58.14 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4843  hypothetical protein  53.33 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3601  hypothetical protein  45.16 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0842659  normal  0.576766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>