23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1290 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1290  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3601  hypothetical protein  94.23 
 
 
62 aa  94.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0842659  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1051  IS4 family transposase  62.79 
 
 
210 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0173  hypothetical protein  46 
 
 
243 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.372645  normal  0.496581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2094  IS4 family transposase  57.78 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2035  hypothetical protein  58.14 
 
 
57 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00355026  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1935  hypothetical protein  58.14 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0520629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  56.41 
 
 
330 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1279  hypothetical protein  56.41 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal  0.0797066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1089  hypothetical protein  56.41 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4827  hypothetical protein  56.41 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.013384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4832  hypothetical protein  56.76 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.870772  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3594  hypothetical protein  56.76 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3588  hypothetical protein  56.76 
 
 
166 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>