30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4887 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1051  IS4 family transposase  99.43 
 
 
633 bp  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4887    100 
 
 
348 bp  690    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4294    99.42 
 
 
558 bp  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2036    93.99 
 
 
240 bp  276  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111141  normal  0.166358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4834    89.73 
 
 
261 bp  216  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1688    90.12 
 
 
192 bp  194  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266755  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3079    82.93 
 
 
525 bp  165  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2094  IS4 family transposase  83.15 
 
 
525 bp  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4931  hypothetical protein  85.53 
 
 
195 bp  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.450305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4559  hypothetical protein  85.53 
 
 
195 bp  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266755  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4554  hypothetical protein  85.53 
 
 
195 bp  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259205  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1198  hypothetical protein  85.53 
 
 
195 bp  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4009    81.65 
 
 
582 bp  125  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1412  hypothetical protein  84.85 
 
 
195 bp  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.511334  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0048    80.15 
 
 
489 bp  93.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4752    90.54 
 
 
469 bp  91.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1651    84.17 
 
 
195 bp  87.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415196  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4898  hypothetical protein  84.17 
 
 
165 bp  87.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4843  hypothetical protein  80.23 
 
 
474 bp  71.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3588  hypothetical protein  78.6 
 
 
501 bp  69.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1279  hypothetical protein  84.04 
 
 
306 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal  0.0797066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3594  hypothetical protein  80.67 
 
 
501 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4827  hypothetical protein  84.04 
 
 
306 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.013384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1089  hypothetical protein  84.04 
 
 
300 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3233    87.88 
 
 
540 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4832  hypothetical protein  79.65 
 
 
474 bp  63.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.870772  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4879  hypothetical protein  78.19 
 
 
501 bp  61.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1659    82.98 
 
 
324 bp  60  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3737    83.54 
 
 
474 bp  54  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0704598  normal  0.0210016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1377    82.5 
 
 
294 bp  48.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>