25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4834 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4834    100 
 
 
261 bp  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1051  IS4 family transposase  89.73 
 
 
633 bp  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4887    89.73 
 
 
348 bp  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4294    89.73 
 
 
558 bp  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1688    87.01 
 
 
192 bp  73.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266755  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0048    81.9 
 
 
489 bp  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4752    87.5 
 
 
469 bp  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2094  IS4 family transposase  81.9 
 
 
525 bp  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3079    81.9 
 
 
525 bp  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4931  hypothetical protein  87.1 
 
 
195 bp  60  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.450305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4559  hypothetical protein  87.1 
 
 
195 bp  60  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266755  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4554  hypothetical protein  87.1 
 
 
195 bp  60  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259205  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4009    81.58 
 
 
582 bp  60  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1651    87.1 
 
 
195 bp  60  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415196  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1412  hypothetical protein  87.1 
 
 
195 bp  60  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.511334  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1198  hypothetical protein  87.1 
 
 
195 bp  60  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3737    85.07 
 
 
474 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0704598  normal  0.0210016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3594  hypothetical protein  85.07 
 
 
501 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3588  hypothetical protein  85.07 
 
 
501 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4832  hypothetical protein  85.07 
 
 
474 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.870772  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4843  hypothetical protein  85.07 
 
 
474 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4879  hypothetical protein  85.07 
 
 
501 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3233    80.91 
 
 
540 bp  52  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4898  hypothetical protein  90.48 
 
 
165 bp  52  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2036    96.43 
 
 
240 bp  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111141  normal  0.166358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>