13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0518 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0518  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  342  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34069  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1948  hypothetical protein  69.33 
 
 
165 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.626737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0888  hypothetical protein  66.46 
 
 
191 aa  231  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000142126 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3951  hypothetical protein  59.71 
 
 
139 aa  183  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1080  hypothetical protein  40.49 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.0256519 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119593  conserved protein of unknown function  41.26 
 
 
195 aa  102  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00737675  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1349  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.441771  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0528  hypothetical protein  35.71 
 
 
171 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0126203  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  27.41 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3375  ureidoglycolate hydrolase  29.17 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0921  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0778  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4115  putative ureidoglycolate hydrolase  21.49 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>