18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1948 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1948  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  349  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.626737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0518  hypothetical protein  69.33 
 
 
163 aa  248  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34069  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0888  hypothetical protein  68.1 
 
 
191 aa  241  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000142126 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3951  hypothetical protein  61.87 
 
 
139 aa  186  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1080  hypothetical protein  43.75 
 
 
172 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.0256519 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119593  conserved protein of unknown function  39.49 
 
 
195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00737675  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1349  hypothetical protein  38.19 
 
 
160 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.441771  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0528  hypothetical protein  35.25 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0126203  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3474  ureidoglycolate hydrolase  32.06 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177168  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3375  ureidoglycolate hydrolase  30.95 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  25.9 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21100  ureidoglycolate hydrolase  25.78 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  25.74 
 
 
169 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2594  ureidoglycolate hydrolase  25.78 
 
 
170 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000285655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  25.74 
 
 
169 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4115  putative ureidoglycolate hydrolase  25.89 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1920  ureidoglycolate hydrolase  23.26 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2738  ureidoglycolate hydrolase  24.43 
 
 
174 aa  40.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.841531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>