30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3054 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3054  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000764336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  30.88 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  31.16 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  37.89 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  27.61 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  35.79 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  21.01 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  25 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  25.34 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  21.52 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  25.71 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  20.74 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  28.03 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  23.08 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  27.66 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  20 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  26.06 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  23.36 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  21.09 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  31.52 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  25.49 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  30.97 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2536  outer membrane protein  25 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  23.81 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  20.28 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  18.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  21.09 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  21.43 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  21.64 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  21.11 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>