17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0103 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0103  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  312  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2053  hypothetical protein  64.34 
 
 
159 aa  201  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0268  hypothetical protein  36.64 
 
 
205 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0445  hypothetical protein  36.64 
 
 
205 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3907  hypothetical protein  30.51 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3698  hypothetical protein  29.66 
 
 
198 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1186  hypothetical protein  28.95 
 
 
204 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0825661  normal  0.0453194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1176  hypothetical protein  28.95 
 
 
204 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172866 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5334  hypothetical protein  29.66 
 
 
198 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10557  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5676  hypothetical protein  29.66 
 
 
198 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.504354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1159  hypothetical protein  28.95 
 
 
204 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3232  hypothetical protein  29.82 
 
 
198 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2870  hypothetical protein  28.81 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5373  hypothetical protein  28.07 
 
 
198 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5731  hypothetical protein  28.07 
 
 
189 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643262  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5297  hypothetical protein  27.19 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.675429  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35507  predicted protein  26.61 
 
 
246 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>