16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0445 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0445  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0268  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2053  hypothetical protein  44.62 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0103  hypothetical protein  36.64 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3907  hypothetical protein  30.17 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1159  hypothetical protein  29.2 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1176  hypothetical protein  29.2 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1186  hypothetical protein  29.2 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0825661  normal  0.0453194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2870  hypothetical protein  27.59 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5373  hypothetical protein  27.68 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3232  hypothetical protein  27.68 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5676  hypothetical protein  26.72 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.504354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3698  hypothetical protein  26.72 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5334  hypothetical protein  26.72 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5731  hypothetical protein  26.79 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5297  hypothetical protein  26.79 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.675429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>