16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2053 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2053  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  330  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0103  hypothetical protein  64.34 
 
 
151 aa  201  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0445  hypothetical protein  44.62 
 
 
205 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0268  hypothetical protein  44.62 
 
 
205 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3907  hypothetical protein  31.97 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1159  hypothetical protein  28.45 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1176  hypothetical protein  28.45 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1186  hypothetical protein  28.45 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0825661  normal  0.0453194 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5676  hypothetical protein  28.68 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.504354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3698  hypothetical protein  28.68 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5334  hypothetical protein  28.68 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10557  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2870  hypothetical protein  27.94 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3232  hypothetical protein  28.23 
 
 
198 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5373  hypothetical protein  27.69 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5297  hypothetical protein  27.69 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.675429  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5731  hypothetical protein  27.69 
 
 
189 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>